생체대사-신호전달 동적 분석 ‘웹셀’ 개발

KAIST 이상엽, 박선원 교수팀, 가상세포 연구 큰 역할 기대

생명체의 대사 및 신호전달 기능과 특성의 동적 분석을 위한 웹 기반 가상세포 분석시스템 WebCell이 개발돼 화제를 모으고 있다.
 
과학기술부 특정연구개발사업 ‘시스템생물학연구사업’에 참여하고 있는 KAIST 생명화학공학과 이상엽, 박선원 교수팀은 26일 ‘WebCell 시스템’을 개발해 공개했다.이 교수팀에 따르면 이 시스템은 현재까지 전 세계적으로 개발된 생체 및 세포 동적 모사 시스템 중 가장 다양한 기능을 제공하는 것으로 시스템 생물학 연구의 국제 공동체인 SBML에 등록돼 공개됐다.
 
이 교수는 “WebCell은 세포 내에서 일어나는 반응들에 대한 결과 예측 뿐 아니라, 시간에 따른 변화들을 보여주는 동적 분석을 상세한 설명을 따라 인터넷 상에서 쉽게 수행할 수 있다”고 전했다.
 
또한, 기존 가상세포 소프트웨어의 프로그램마다 다른 형식으로 이뤄져 사용에 어려움이 많던 파일들도 자유롭게 원하는 양식으로 변환이 가능하도록 해, 연구 과정과 결과를 공유해 더 빠르고 효율적인 연구가 가능해졌다고 덧붙였다.아울러 인터넷 상에서 생물학적 네트워크를 모델링하고 만들어진 모델을 저장 및 교환할 수 있으며, 열역학 정보를 이용한 모델 검증, 변수 추정, 구조적 경로 분석 및 대사 조절 분석, 동적 시각화 등을 통한 네트워크의 체계적인 분석 기능을 통합적으로 제공하는 장점을 갖추고 있다.이 교수팀은 “기존에 발표된 모델들의 라이브러리도 제공하며 이용자가 자신의 ID로 접속할 수 있는 개인 라이브러리도 가질 수 있으므로, 가상세포 연구에 큰 역할을 할 것”이라고 기대했다.
한편 이 같은 연구결과는 영국 옥스퍼드대학 출판사 발간 생물정보학 관련 전문 학술지인 바이오인포메틱스 (Bioinformatics)지 5월호에 게재됐다.
WebCell 시스템은 웹브라우저를 통해 http://webcell.kaist.ac.kr 이나 http://www.webcell.org로 접속하여 사용자 계정을 획득한 뒤 이용할 수 있다.
이상훈 기자([e-mail])
2006-04-27